Jag gillar att utforska vad transparensen kan göra för oss. Jag ser ingen som helst motsättning mot att vara en hårdnackad FRA-motståndare å ena sidan, och kontinuerligt gå längre och längre med den självvalda transparensen å andra sidan. Testar ju med min kalender, min vikt, mina inköp och mycket annat.
Via min profilsida på tjänsten 23andMe går det inte att göra sig så transparent som jag skulle önska. På goda grunder, de flesta anser säkert att det är hål i huvudet att publicera över 14 miljoner rader med SNP-data. Min genotyp/genom i rådata-form, alltså. Så här ser jag ut, förenklad i bildform:
För den som vill gräva vidare finns här en zip-fil på 5MB och samma data som okomprimerad text (14MB, över 14 miljoner rader). Så här inleds textfilen:
# This data file generated by 23andMe at: Sun Mar 28 04:27:41 2010 # # Below is a text version of your data. Fields are TAB-separated # Each line corresponds to a single SNP. For each SNP, we provide its identifier # (an rsid or an internal id), its location on the reference human genome, and the # genotype call oriented with respect to the plus strand on the human reference # sequence. We are using reference human assembly build 36. Note that it is possible # that data downloaded at different times may be different due to ongoing improvements # in our ability to call genotypes. More information about these changes can be found at: # https://www.23andme.com/you/download/revisions/ # # More information on reference human assembly build 36: # http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map_search.cgi?taxid=9606&build=36 # # rsid chromosome position genotype rs3094315 1 742429 AA rs12562034 1 758311 AG rs3934834 1 995669 CC rs9442372 1 1008567 AA rs3737728 1 1011278 AG rs11260588 1 1011521 GG rs6687776 1 1020428 CC rs9651273 1 1021403 AG rs4970405 1 1038818 AA rs12726255 1 1039813 AA
Vore fantastiskt spännande om någon hittade någon nytta med min publicerade data – antingen praktiskt eller teoretiskt. Om inte annat så lovar jag att själv återkomma när jag stämt av med min granne här hemma, smartskalle och forskare inom precis det här området.
Uppdatering: Jag fick en fråga om licensen för mitt material på bloggen också gäller för min genotyp. Självklart. De två filerna du kan plocka hem är alltså fria att använda (även kommersiellt) enligt CC-BY. Men om du hackar loss så undanber jag mig alla försöka att checka in modifierad kod i mig ;)
Ja, detta är transparens driven till sin spets, tycker jag! Om inte annat är det lite kul att fundera över hur detta egentligen skulle kunna användas och av vem i så fall. Själv är jag också transparent i biologisk mening iom att jag har lagt ut röngenbilder av min hjärna på en av mina bloggar. Snacka om see through. http://knoppenihjarnan.wordpress.com/fakta/ (längst ner på sidan, obs varning till er känsliga)
Jisses vad stor den ser ut. Befriande att läsa din fakta-text, den är verkligen rakt på. Strongt, och tack för en good read.
När det gäller mitt eget lilla experiment så har jag verkligen ingen aning vad det ska leda till. Som så ofta idag vet vi inte det förrän efteråt.
Sjukt fascinerande med denna tjänst. Blir sugen på att prova själv. Men vad är det man får? Bara all sin DNA som rådata? Får man ingen schysst sammanställning med sjukdomar man riskerar drabbas av, tips på karriärbanor grundat på ens genetiska talanger osv.? DET vore riktigt coolt :)
Förresten din profilsida kräver inloggning för att man ska kunna se den, men det kanske du visste.
Hoppsan, jag trodde faktiskt man kom åt min profilsida utan inloggning. Sorry. Men den är verkligen tunn. För att se vad du får i tjänsten klicka på http://www.23andme.com/ istället – men svaret är att du får precis det du efterlyser (minus karrärbiten;) Rådata är den lilla, lilla delen av tjänsten.
Man försöker, på ett väldigt försiktigt sätt, berätta om allt sådant som dina gener potentiellt kan berätta om dig. Det är väldigt snyggt gjort.
Du får väl börja se upp för kloner framöver! :=)
Haha… Härligt! Kanske någon plöjer igenom din DNA och hittar fler genialiska förmågor som du själv inte upptäckt ännu! :-)
Keep goin strong!
Nej, man får inte sitt DNA som rådata. Sådant är fortfarande dyrt och svårt att göra. Man får sina fenotyper, eller vad det nu heter. Standardsekvenser av DNA och var de matchar mot ens egen arvsmassa. Det är möjligt att datat är konverterat till basparsform, men det är fusk i så fall.
Jag bloggade om ditt transparens-projekt idag igen. Jag är inte lika transparent:
http://lakonism.blogspot.com/2010/05/svenska-tv…
Jag förstår dig mycket väl. Skillnaden ligger i var initiativet kommer från ;)
Bra att du håller grytan kokande!
Hello Joakim,
are you interested to join the HIR Search project ?
http://hirs.snpology.com
Your genome data will be compared to more than 500 participants data to reveal potential relatives.
Regards,
Leon Kull
Yes, would love to. Let me know how!